Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6stQ00560 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il6stQ00560 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Il6stQ00560 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms