Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms