Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cry1P97784 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cry1P97784 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cry1P97784 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cry1P97784 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cry1P97784 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cry1P97784 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cry1P97784 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cry1P97784 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms