Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcc1P97496 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcc1P97496 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms