Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas1P97459 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas1P97459 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas1P97459 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas1P97459 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas1P97459 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas1P97459 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms