Protein–RNA interactions for Protein: P97440

Slbp, Histone RNA hairpin-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlbpP97440 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlbpP97440 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlbpP97440 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlbpP97440 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlbpP97440 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms