Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nbr1P97432 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms