Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps45P97390 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps45P97390 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps45P97390 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps45P97390 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps45P97390 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps45P97390 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps45P97390 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps45P97390 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms