Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhodP97348 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhodP97348 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhodP97348 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhodP97348 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhodP97348 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhodP97348 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhodP97348 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhodP97348 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhodP97348 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhodP97348 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhodP97348 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RhodP97348 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhodP97348 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhodP97348 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RhodP97348 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RhodP97348 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RhodP97348 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RhodP97348 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhodP97348 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhodP97348 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RhodP97348 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhodP97348 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhodP97348 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhodP97348 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhodP97348 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhodP97348 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhodP97348 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhodP97348 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhodP97348 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhodP97348 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhodP97348 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhodP97348 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhodP97348 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhodP97348 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhodP97348 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhodP97348 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RhodP97348 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhodP97348 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhodP97348 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhodP97348 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RhodP97348 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhodP97348 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhodP97348 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhodP97348 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhodP97348 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhodP97348 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhodP97348 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhodP97348 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhodP97348 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhodP97348 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhodP97348 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhodP97348 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhodP97348 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhodP97348 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhodP97348 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhodP97348 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhodP97348 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhodP97348 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhodP97348 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhodP97348 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhodP97348 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhodP97348 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhodP97348 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhodP97348 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RhodP97348 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhodP97348 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhodP97348 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RhodP97348 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhodP97348 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RhodP97348 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhodP97348 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms