Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NyxP83503 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NyxP83503 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NyxP83503 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NyxP83503 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NyxP83503 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NyxP83503 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NyxP83503 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NyxP83503 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NyxP83503 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NyxP83503 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NyxP83503 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NyxP83503 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NyxP83503 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NyxP83503 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NyxP83503 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NyxP83503 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NyxP83503 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NyxP83503 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NyxP83503 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NyxP83503 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NyxP83503 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NyxP83503 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NyxP83503 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NyxP83503 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NyxP83503 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NyxP83503 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NyxP83503 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NyxP83503 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NyxP83503 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NyxP83503 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NyxP83503 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NyxP83503 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NyxP83503 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NyxP83503 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NyxP83503 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NyxP83503 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NyxP83503 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NyxP83503 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NyxP83503 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NyxP83503 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NyxP83503 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NyxP83503 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NyxP83503 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NyxP83503 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NyxP83503 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NyxP83503 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NyxP83503 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NyxP83503 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NyxP83503 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NyxP83503 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NyxP83503 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NyxP83503 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NyxP83503 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NyxP83503 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NyxP83503 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NyxP83503 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NyxP83503 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NyxP83503 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NyxP83503 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NyxP83503 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NyxP83503 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NyxP83503 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NyxP83503 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NyxP83503 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NyxP83503 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NyxP83503 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NyxP83503 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NyxP83503 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NyxP83503 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NyxP83503 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NyxP83503 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NyxP83503 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NyxP83503 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NyxP83503 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NyxP83503 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NyxP83503 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NyxP83503 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NyxP83503 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NyxP83503 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NyxP83503 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NyxP83503 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NyxP83503 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NyxP83503 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NyxP83503 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NyxP83503 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NyxP83503 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NyxP83503 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NyxP83503 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NyxP83503 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NyxP83503 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NyxP83503 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NyxP83503 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NyxP83503 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NyxP83503 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NyxP83503 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NyxP83503 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NyxP83503 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NyxP83503 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NyxP83503 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms