Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8a1P70704 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms