Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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