Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb13P70321 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb13P70321 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb13P70321 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hoxb13P70321 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Hoxb13P70321 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxb13P70321 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb13P70321 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms