Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pitx1P70314 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx1P70314 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pitx1P70314 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pitx1P70314 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pitx1P70314 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pitx1P70314 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx1P70314 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx1P70314 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx1P70314 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx1P70314 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx1P70314 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx1P70314 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx1P70314 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx1P70314 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx1P70314 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms