Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3eP70275 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms