Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdlim4P70271 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms