Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actg1P63260 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actg1P63260 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Actg1P63260 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actg1P63260 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Actg1P63260 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms