Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms