Protein–RNA interactions for Protein: P63005

Pafah1b1, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b1P63005 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pafah1b1P63005 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pafah1b1P63005 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms