Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl23P62830 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms