Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vsnl1P62761 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms