Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnrpfP62307 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms