Protein–RNA interactions for Protein: P62257

Ube2h, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2hP62257 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ube2hP62257 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ube2hP62257 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube2hP62257 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms