Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psme3P61290 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme3P61290 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms