Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abce1P61222 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abce1P61222 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abce1P61222 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abce1P61222 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abce1P61222 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abce1P61222 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abce1P61222 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Abce1P61222 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Abce1P61222 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abce1P61222 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms