Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr2fP61219 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms