Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4P59383 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4P59383 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4P59383 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4P59383 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4P59383 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4P59383 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4P59383 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4P59383 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrn4P59383 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrn4P59383 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrn4P59383 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrn4P59383 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn4P59383 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrrn4P59383 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn4P59383 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn4P59383 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn4P59383 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn4P59383 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn4P59383 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn4P59383 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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