Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms