Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vps33bP59016 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps33bP59016 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms