Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhbdl3P58873 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rhbdl3P58873 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms