Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpdl3bP58242 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms