Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtnsP57757 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtnsP57757 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CtnsP57757 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtnsP57757 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtnsP57757 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtnsP57757 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CtnsP57757 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms