Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms