Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rp1P56716 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rp1P56716 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rp1P56716 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rp1P56716 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rp1P56716 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp1P56716 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp1P56716 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp1P56716 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp1P56716 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rp1P56716 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rp1P56716 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rp1P56716 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rp1P56716 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rp1P56716 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rp1P56716 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rp1P56716 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms