Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gp1bbP56400 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms