Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab4aP56371 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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