Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp1P56183 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1P56183 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms