Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms