Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PctpP53808 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PctpP53808 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PctpP53808 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PctpP53808 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PctpP53808 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PctpP53808 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PctpP53808 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PctpP53808 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PctpP53808 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PctpP53808 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PctpP53808 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PctpP53808 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PctpP53808 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PctpP53808 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PctpP53808 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PctpP53808 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PctpP53808 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PctpP53808 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PctpP53808 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PctpP53808 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PctpP53808 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PctpP53808 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PctpP53808 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PctpP53808 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PctpP53808 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PctpP53808 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PctpP53808 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PctpP53808 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PctpP53808 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PctpP53808 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PctpP53808 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PctpP53808 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PctpP53808 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PctpP53808 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PctpP53808 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PctpP53808 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PctpP53808 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PctpP53808 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PctpP53808 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PctpP53808 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PctpP53808 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PctpP53808 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PctpP53808 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PctpP53808 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PctpP53808 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PctpP53808 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PctpP53808 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PctpP53808 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PctpP53808 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PctpP53808 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PctpP53808 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PctpP53808 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PctpP53808 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PctpP53808 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PctpP53808 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PctpP53808 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PctpP53808 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PctpP53808 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PctpP53808 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PctpP53808 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PctpP53808 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PctpP53808 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PctpP53808 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PctpP53808 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PctpP53808 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PctpP53808 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PctpP53808 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PctpP53808 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PctpP53808 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PctpP53808 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PctpP53808 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PctpP53808 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PctpP53808 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PctpP53808 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PctpP53808 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PctpP53808 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PctpP53808 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PctpP53808 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PctpP53808 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PctpP53808 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PctpP53808 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PctpP53808 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PctpP53808 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PctpP53808 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PctpP53808 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PctpP53808 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PctpP53808 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PctpP53808 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PctpP53808 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PctpP53808 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PctpP53808 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PctpP53808 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PctpP53808 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PctpP53808 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PctpP53808 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PctpP53808 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PctpP53808 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PctpP53808 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PctpP53808 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 286.7 ms