Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e1P52482 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2e1P52482 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms