Protein–RNA interactions for Protein: P51954

Nek1, Serine/threonine-protein kinase Nek1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek1P51954 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek1P51954 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek1P51954 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek1P51954 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek1P51954 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek1P51954 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek1P51954 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek1P51954 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek1P51954 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek1P51954 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek1P51954 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek1P51954 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek1P51954 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek1P51954 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek1P51954 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek1P51954 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms