Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LumP51885 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LumP51885 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LumP51885 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LumP51885 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LumP51885 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LumP51885 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LumP51885 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LumP51885 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LumP51885 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LumP51885 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LumP51885 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LumP51885 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LumP51885 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LumP51885 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LumP51885 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LumP51885 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LumP51885 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LumP51885 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LumP51885 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LumP51885 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LumP51885 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LumP51885 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LumP51885 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LumP51885 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LumP51885 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LumP51885 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LumP51885 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LumP51885 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LumP51885 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LumP51885 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LumP51885 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LumP51885 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LumP51885 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LumP51885 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LumP51885 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LumP51885 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LumP51885 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LumP51885 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LumP51885 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LumP51885 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LumP51885 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LumP51885 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LumP51885 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LumP51885 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LumP51885 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LumP51885 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LumP51885 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LumP51885 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LumP51885 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LumP51885 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LumP51885 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LumP51885 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LumP51885 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LumP51885 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LumP51885 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LumP51885 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LumP51885 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LumP51885 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LumP51885 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LumP51885 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LumP51885 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LumP51885 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LumP51885 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LumP51885 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LumP51885 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LumP51885 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LumP51885 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LumP51885 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LumP51885 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LumP51885 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LumP51885 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms