Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CastP51125 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CastP51125 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CastP51125 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CastP51125 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CastP51125 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CastP51125 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CastP51125 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CastP51125 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CastP51125 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CastP51125 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CastP51125 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CastP51125 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CastP51125 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CastP51125 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CastP51125 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CastP51125 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CastP51125 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CastP51125 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CastP51125 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CastP51125 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CastP51125 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CastP51125 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CastP51125 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CastP51125 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CastP51125 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CastP51125 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CastP51125 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CastP51125 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CastP51125 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CastP51125 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CastP51125 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CastP51125 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CastP51125 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CastP51125 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CastP51125 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CastP51125 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CastP51125 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CastP51125 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CastP51125 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CastP51125 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CastP51125 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CastP51125 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CastP51125 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CastP51125 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CastP51125 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CastP51125 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CastP51125 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CastP51125 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CastP51125 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CastP51125 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CastP51125 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CastP51125 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CastP51125 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CastP51125 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CastP51125 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CastP51125 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CastP51125 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CastP51125 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CastP51125 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CastP51125 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CastP51125 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CastP51125 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CastP51125 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CastP51125 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CastP51125 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CastP51125 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CastP51125 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CastP51125 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CastP51125 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CastP51125 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CastP51125 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CastP51125 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CastP51125 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CastP51125 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CastP51125 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CastP51125 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CastP51125 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CastP51125 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CastP51125 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CastP51125 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CastP51125 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CastP51125 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CastP51125 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CastP51125 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CastP51125 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CastP51125 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CastP51125 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CastP51125 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CastP51125 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CastP51125 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CastP51125 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CastP51125 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CastP51125 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CastP51125 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CastP51125 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CastP51125 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CastP51125 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CastP51125 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CastP51125 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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