Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt2P50752 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms