Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa-rs12P50716 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa-rs12P50716 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa-rs12P50716 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa-rs12P50716 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa-rs12P50716 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa-rs12P50716 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa-rs12P50716 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs12P50716 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms