Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FmodP50608 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FmodP50608 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FmodP50608 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FmodP50608 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FmodP50608 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FmodP50608 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FmodP50608 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FmodP50608 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FmodP50608 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FmodP50608 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FmodP50608 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FmodP50608 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FmodP50608 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FmodP50608 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FmodP50608 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FmodP50608 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FmodP50608 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FmodP50608 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FmodP50608 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FmodP50608 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FmodP50608 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FmodP50608 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FmodP50608 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FmodP50608 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FmodP50608 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FmodP50608 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FmodP50608 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FmodP50608 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FmodP50608 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FmodP50608 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FmodP50608 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FmodP50608 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FmodP50608 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FmodP50608 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FmodP50608 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FmodP50608 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FmodP50608 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FmodP50608 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FmodP50608 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FmodP50608 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FmodP50608 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FmodP50608 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FmodP50608 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FmodP50608 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FmodP50608 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FmodP50608 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FmodP50608 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FmodP50608 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FmodP50608 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FmodP50608 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FmodP50608 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FmodP50608 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FmodP50608 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FmodP50608 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FmodP50608 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FmodP50608 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FmodP50608 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FmodP50608 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FmodP50608 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FmodP50608 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FmodP50608 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FmodP50608 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FmodP50608 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FmodP50608 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FmodP50608 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FmodP50608 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FmodP50608 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms