Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx2-1P50220 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms