Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbp3P49194 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms