Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ercc3P49135 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms