Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prox1P48437 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prox1P48437 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prox1P48437 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prox1P48437 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Prox1P48437 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms